二氧化氯消毒劑是國際上公認的高效消毒滅菌劑。它可以殺滅一切微生物，包括細菌繁殖體， 細菌芽孢，真菌，分枝桿菌和病毒等，并且這些細菌不會產(chǎn)生抗藥性。但飲用水用二氧化氯消毒后會產(chǎn)生亞氯酸鹽等消毒副產(chǎn)物。水中亞氯酸鹽及氯酸鹽的含量多少是評價二氧化氯作為飲水消毒劑安全性的重要指標。